九方思乐

生物医学统计分析平台 · math81.com

📐 基础统计

🔍 NormalityTest 正态性与方差齐性检验

R/Shiny

Shapiro-Wilk、K-S检验、Levene、Bartlett方差齐性检验

📊 HypothesisTest 假设检验

R/Shiny

t检验、配对t检验、Mann-Whitney、Wilcoxon符号秩、卡方检验、Fisher精确检验

📈 ANOVA 方差分析

R/Shiny

单因素ANOVA、双因素ANOVA、重复测量ANOVA、事后多重比较

🔗 Correlation 相关分析

R/Shiny

Pearson/Spearman/Kendall相关分析、相关矩阵、偏相关

📉 LinearRegression 线性回归

R/Shiny

简单/多元线性回归、逐步回归、残差诊断、共线性检验

📊 LogisticRegression 逻辑回归

R/Shiny

二分类/多分类/有序逻辑回归、OR+CI、Hosmer-Lemeshow检验

📈 PeakFinder 峰检测与拟合

R/Shiny

通用峰检测与拟合,SG 平滑、基线校正、Prominence、FWHM、抛物线精修、高斯分峰

📊 ModelCompare 模型比较

R/Shiny

多模型AIC/BIC/RMSE/MAE对比,残差诊断,模型选择

🌲 SubgroupForest 亚组森林图

R/Shiny

亚组分析与交互作用检验,分层森林图可视化

🧮 统计 & 数据清洗

🧮 SampleSize 样本量计算

R/Shiny

样本量与检验功效计算器

📋 TableOne 三线表生成器

R/Shiny

自动正态性检验、三线表生成、统计分布可视化、Word/Excel导出

📈 ROCAnalysis ROC曲线分析

R/Shiny

AUC+CI、最佳截断值、混淆矩阵、阈值曲线、DeLong检验、Bootstrap CI、动态滑块、Word/Excel导出

⏱️ TimeDependROC 时间依赖ROC

R/Shiny

生存数据时间依赖ROC曲线分析,AUC(t)、最佳截断值、混淆矩阵、阈值曲线、动态滑块、CSV/Word导出

🔄 MultipleImputation 多重插补

R/Shiny

缺失数据多重插补,18种方法(mice / 简单插补 / 热图可视化)

📈 DecisionCurve 决策曲线分析

R/Shiny

多模型净收益比较、阈值概率分析、Combined Model、Threshold Probe交互标注、最优阈值范围识别

📊 SurvivalDCA 生存决策曲线

R/Shiny

时间依赖DCA,IPCW法处理删失,多时间点净收益对比

📊 BlandAltman 一致性分析

R/Shiny

两种测量方法一致性评估,偏倚+一致性界限+CI+正态性检验+百分比BA图

📊 PropensityScore 倾向性评分匹配

R/Shiny

PSM因果推断,MatchIt匹配+SMD平衡评估+治疗效应估计

📊 CompetingRisk 竞争风险模型

R/Shiny

Fine-Gray子分布回归,CIF累积发病率,Gray检验,Schoenfeld残差PH检验

📈 RCSAnalysis 限制性立方样条

R/Shiny

非线性剂量反应建模,P-for-nonlinearity检验,拐点自动识别,连续型森林图

📊 ICCAnalyzer 组内相关系数分析

R/Shiny

6种ICC(Shrout & Fleiss 1979),方差分量分解,ANOVA表,CI计算,F检验

📊 列线图与动态预测

📊 NomogramSurvival 生存列线图

R/Shiny

Cox回归列线图,生存概率预测

📉 DynNomSurvival 动态列线图(生存)

R/Shiny

交互式Cox回归动态预测

📈 NomogramBuilderCox 生存列线图构建

R/Shiny

交互式Cox回归列线图构建器,支持时间节点选择与校准

📈 NomogramLogistic 逻辑回归列线图

R/Shiny

逻辑回归列线图,概率预测

🎚️ DynNom 动态列线图(逻辑回归)

R/Shiny

交互式逻辑回归动态预测

📊 NomogramBuilderLogistic 逻辑回归列线图构建

R/Shiny

交互式逻辑回归列线图构建器,支持变量选择与参数调优

🔄 完整分析工作流
🔄

SciFlow

端到端分析工作流
SciFlow

逻辑回归与 Cox 生存分析的端到端分析流程,从数据上传到报告生成一站式完成

进入工作流 →
🧪 小样本建模

📊 LogisticSmall 小样本逻辑回归

R/Shiny

K折/LOOCV交叉验证,AUC/校准图/混淆矩阵/Nomogram(开发中)

📈 CoxSmall 小样本Cox回归

R/Shiny

K折/LOOCV交叉验证,C-index/Time-AUC/校准图/森林图/Nomogram(开发中)

🧬 生物信息分析

📈 SurvivalAnalysis 生存分析

R/Shiny

Kaplan-Meier曲线、Log-rank检验、Cox回归、ggsurvfit可视化

✂️ KMcutoff 最优截断值

R/Shiny

Kaplan-Meier最优截断值搜索,支持连续变量X-tile与ROC截断

📈 SurvivalFeatureSelector 生存特征筛选

R/Shiny

Cox-LASSO/RSF/单变量Cox筛选→交集→逐步Cox→建模

🔍 FeatureSelector 多方法特征筛选

R/Shiny

LASSO/Boruta/随机森林/互信息/mRMR/卡方筛选→交集→逐步回归→Logistic建模

🔍 UnsupervisedClustering 无监督聚类

R/Shiny

K-Means、K-Medoids、层次聚类、DBSCAN、GMM、谱聚类

🧬 BioChip (Class) 基因表达芯片分析

R/Shiny

预处理、差异分析、KEGG富集、PCA/t-SNE/UMAP降维、相关性分析

🧬 BioChipSurvival 芯片生存分析

R/Shiny

Cox回归筛选生存相关基因、KM曲线、森林图、GO/KEGG富集

🧬 PathwayAnalysis 通路富集分析

R/Shiny

基因列表输入,KEGG/GO/Reactome 富集分析,ORA & GSEA,可视化

🏥 医学健康

🦠 EpiBuilder 流行病学建模

Python/Streamlit

SIR/SEIR/SEIRD/SIS 等经典模型,自定义仓室模型,MCMC参数拟合,R0 基本再生数计算与推导

📊 RA-CUSUM 学习曲线

R/Shiny

风险调整累积和控制图,医疗质量监测

💉 AnestheticDoseFinding 麻醉剂量

R/Shiny

麻醉剂量寻找与优化

📏 HeightWeight 儿童身高体重

R/Shiny

WHO儿童生长发育标准曲线

📐 HeightWeightChinese 中国儿童身高体重

R/Shiny

中国儿童生长发育标准曲线

🧪 qPCR 分析

🧬 PrimerDesigner 引物设计

Python/Streamlit

Primer3自动设计、NCBI序列获取、BLAST特异性检查、跨外显子判断、可视化对齐

🧬 MultiPrimer 多重PCR引物设计

Python/Streamlit

多靶标并行设计、引物池兼容性筛选、产物分级电泳、自动分组优化

🔍 PrimerQC 引物质量评价

Python/Streamlit

单对/批量引物质量评价,Tm/GC/二级结构/特异性评分

🧪 qPCR_CT CT值分析

R/Shiny

96孔板CT值分析,扩增曲线、相对定量、统计可视化

🌡️ qPCR_TM 熔解曲线分析

R/Shiny

Tm峰检测、熔解曲线分析、引物特异性评估

📥 Read_qPCR_CT CT值读取

R/Shiny

上传qPCR文件读取CT值,数据预处理

📥 Read_qPCR_TM 熔解曲线读取

R/Shiny

上传qPCR文件读取熔解曲线数据,Tm分析

🔬 qPCR_AbsQuant 绝对定量

R/Shiny

标准曲线绝对定量,扩增效率评估,未知样本浓度计算

📊 qPCR_RelQuant 相对定量

R/Shiny

DDCT法/Pfaffl法相对定量,多内参归一化,统计检验,火山图

🌡️ qPCR_TM_Pro 熔解曲线分析(Pro)

R/Shiny

高斯核加权抛物线拟合,自适应窗口,Tm标准误与95%CI,loess+SG导数寻峰

📉 函数拟合

📉 CurveFit1D 一元曲线拟合

Python/Streamlit

45种内置函数、自定义公式、多峰拟合、批量扫描、异常值检测、预测器

🎯 CurveFit2D 二元曲面拟合

Python/Streamlit

25种二元函数,3D散点+曲面+等高线,智能初始值

🔢 CurveFitND 多元函数拟合

Python/Streamlit

3-5变量自定义公式拟合,预测值vs实际值,残差诊断

📏 StandardCurve 标准曲线

R/Shiny

标准曲线绘制与浓度计算

🔬 EqDiscovery 方程发现

Python/Streamlit

符号回归自动从数据中发现数学方程,PySR驱动

🧠 分类与神经网络

🔮 SupervisedClustering 监督分类

Python/Streamlit

逻辑回归、LDA、QDA、决策树、随机森林、XGBoost、SVM、K-NN、朴素贝叶斯

NeuralFeatureLR 神经网络特征+逻辑回归

Python/Streamlit

NN特征提取+逻辑回归 vs 纯逻辑回归对比分析

📉 NNRegression 神经网络回归

Python/Streamlit

TensorFlow/Keras 回归拟合,MSE/MAE/R²评估

🔀 NNBinaryClass 神经网络二分类

Python/Streamlit

TensorFlow/Keras 二分类,混淆矩阵+ROC+决策边界

🎯 NNMultiClass 神经网络多分类

Python/Streamlit

TensorFlow/Keras 多分类,Softmax输出+分类报告

🔔 BayesianGaussian 贝叶斯高斯分类

Python/Streamlit

贝叶斯高斯分类器,概率密度估计与分类

⚛️ 物理化学

📊 MHLoopAnalyzer 磁滞回线分析仪

R/Shiny

超导材料 M-H 磁滞回线背景扣除、基线拟合、Jc 计算

⚛️ SOBP 质子束展宽布拉格峰

Python/Streamlit

⚗️ AdsorptionKinetics 吸附动力学

R/Shiny

吸附动力学拟合分析

🎮 益智游戏

🎮 24Game 24点游戏

R/Shiny

经典24点数学游戏

🛠️ 工具软件

✏️ WhiteBoard 白板

R/Shiny

在线协作白板

🧪 AppSandbox App测试

R/Shiny

复制→编辑→测试→替换,Shiny App 在线管理与部署工具

🧪 AppSandbox Streamlit沙箱

Python/Streamlit

复制→编辑→测试→Diff→替换,Streamlit App 在线管理与部署工具